Добрый день.
Немного непонятно, зачем писать в регистры? Достаточно выбрать верный шаблон, в нем указаны все setup-регистры, которые записываются во флеш MIO.
Но если хотите конфигурировать вручню: https://support.wirenboard.com/t/help-wb-mio-and-wbio-di-wd-14/