Практически всегда CO2 = 400

Перед установкой вполне возможно, но не удобно конечно.

Может сделать кнопку на плате для ручной калибровки и отключения автоматической?

У вас же железка должна знать о показаниях датчика CO2 за неделю. Может есть возможность автоматически отключать автокалибровку, если уровень CO2 не упал за неделю до 400?

Дома или в квартире достаточно хорошо проветрить комнату, открыв окна.

Датчик в любом случае подключен по сети RS-485, в шаблоне контроллера есть переключатель для ручной калибровки. Вроде, это не должно вызывать проблем?

Уровень CO2 может не упасть до 0 (например, из-за старения лазера сенсора, изменения состава воздуха и пр). Калибровка как раз призвана компенсировать эти изменения.