Проксирование нескольких контроллеров через NGINX

Откуда загружать сам интерфейс (статику) - совершенно без разницы.
Важное - именно настройки подключения к mqtt контроллера (контроллеров). То есть указанное в Настройки → Веб-интерфейс.

И да, эти параметры подгружаются из cookies браузера пользователя, так что править все равно надо для выбранного метода.