Здравствуйте!
Именно после apt update? Эта команда только обновляет списки доступных пакетов. Или после apt upgrade?
Мы рекомендуем устанавливать zigbee2mqtt и nodejs пакетами из наших репозиториев. Сейчас доступны:
zigbee2mqtt: 1.25.2
nodejs: 12.19.0-1nodesource1
Если при этом используется Node-Red, то нужно устанавливать версию 2.2, которая поддерживает nodejs v12. Иначе начинаются несовместимости версий.