Спасибо за совет!
Если правильно понял документацию представленную на zigbee2mqtt то лог там один и я его выложил ранее mnt/data/root/zigbee2mqtt/data/log в нем я ничего не нашел, в части следов попыток удаления устройств.
Пошел другим путем - внес правки в configuration.yaml добавил строку frontend: true после чего по адресу контроллера и порту 8080 зашел в WUI zigbee2mqtt, где в перечне устройств удалил фантомы с галочкой принудительное удаление - все получилось, не существующих устройств не стало в сети и в WUI Wirenboard.