Отлично!
Смотрите, настройки не отображаются по умолчанию в веб-интерфейсе, можно добавить в шаблон нужные регистры, но мы сами так не делаем из коробки, потому что есть риск случайно что-то изменить, а потом недоумевать 
Привязку входов к реле можно отключить записью в соответствующий holding-регистр, тогда всё управление можно будет переложить на контроллер: он будет отслеживать состояние входов и изменять состояние реле как необходимо. Перед изъятием контроллера нужно снова привязать входы к реле.
В этой теме есть обсуждение деталей.