Не зная, что вы установили, я не могу подсказать, что переносить.
Например, вы установили docker - нужно перенести его директории и заменить символическими ссылками. Директории установки можно смотреть или в самих пакетах или по имени на контроллере искать или в сети погуглить. Но делать это нужно внимательно и осознанно. Если опыта с Linux мало, то сначала его немного изучить. В этом контроллер ничем не отличается от обычного компьютера.
На портале есть похожие темы, советую почитать еще их:
У разработчиков есть задача по увеличению раздела /dev/root. Пока ждем ее реализации.