Добрый день.
Покажите пожалуйста отправляемые в счетчик комfнды (запросы) именно байтами, ну и ответы на них.
Потому что пока не очень понятно что ожидаете считать из регистра.
Посмотрите: WB-MAP12E настройка коэффициентов трансформации
Так, а что вы ожидаете прочитать из старшей части регистра uptime?
Она будет ненулевой через 65536 секунд после включения модуля.
когда читаете вместе с младшей - у вас возвращается uptime нормальный.