Судя по логу, вы начали установку Node-red вручную (вижу что прописывалиapt update && apt install -y nodejs git make g++ gcc build-essential) и не закончили ее. Эти компоненты в связке с wb-hdmi и занимают почти все свободное пространство корня.
Предлагаю вам удалить следы с этой не законченной установки, приложите вывод команд сюда. Посмотрим сколько места освободится, потом выполним удаление.
apt purge build-essential gcc g++ make -s
apt autoremove --purge -s
После удаления переустановим Node-red через докер по инструкции. Там основная часть будет лежать уже в /mnt/