Переключитесь на testing релиз, в нем есть механизмы нивелирующие влияние переходных процессов старта, разное время запуска служб. В ближайшем релизу - уже будет в стабильном.
[ 3177.031092] usb 2-1-port3: disabled by hub (EMI?), re-enabling...
Ну и
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 pppd[9678]: nm-ppp-plugin: status 5 / phase 'establish'
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 pppd[9678]: Connect: ppp0 <--> /dev/ttyUSB2
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 NetworkManager[5157]: <info> [1714661301.3982] manager: (ppp0): new Ppp device (/org/freedesktop/NetworkManager/Devices/40)
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 kernel: usb 2-1.3: USB disconnect, device number 23
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 kernel: rndis_host 2-1.3:1.0 usb0: unregister 'rndis_host' usb-ci_hdrc.1-1.3, RNDIS device
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 avahi-daemon[286]: Withdrawing workstation service for usb0.
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 kernel: option1 ttyUSB0: GSM modem (1-port) converter now disconnected from ttyUSB0
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 kernel: option 2-1.3:1.2: device disconnected
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 ModemManager[329]: <info> [base-manager] port ttyUSB0 released by device 'wbc'
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 kernel: option1 ttyUSB1: GSM modem (1-port) converter now disconnected from ttyUSB1
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 ModemManager[329]: <info> [base-manager] port ttyUSB1 released by device 'wbc'
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 ModemManager[329]: <info> [base-manager] port usb0 released by device 'wbc'
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 kernel: option 2-1.3:1.4: device disconnected
May 02 17:48:21 wirenboard-AARESAB7 pppd[9678]: Modem hangup
То есть в процессе установки соединения - отключение USB устройств, как только модема так и вместе с Wi-Fi.
Контроллер стоит в металлическом щите? А какай антенна используется для GSM связи, каким кабелем подключена?